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DNA甲基化檢測(cè)(重亞硫酸鹽處理)試劑盒

DNA甲基化檢測(cè)(重亞硫酸鹽處理)試劑盒

       DNA甲基化是一種基本的表觀遺傳學(xué)修飾,在基因表達(dá)調(diào)控、發(fā)育調(diào)節(jié)、基因組印跡等方面發(fā)揮重要作用。在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,CpG雙核苷的胞嘧啶第5 位碳原子被選擇性地添加甲基基團(tuán)。 在人類(lèi)腫瘤中,普遍發(fā)生甲基化異常的現(xiàn)象,由于甲基化與胚胎發(fā)育、細(xì)胞周期調(diào)控相關(guān),因此DNA甲基化狀態(tài)的變化可作為疾病診斷和預(yù)后的一個(gè)有用的指示器。

       最早在1970年,重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化就被用于鑒別DNA中的胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶(5-mC)。現(xiàn)在認(rèn)為在重亞硫酸鹽處理過(guò)程中,5-甲基胞嘧啶(5-mC)和5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)都不會(huì)發(fā)生堿基的變化,因此這種方法不能用來(lái)區(qū)別不同的甲基化修飾。在重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化過(guò)程中,DNA首先用重亞硫酸鈉處理,在高溫和低pH條件下,將變性DNA(單鏈DNA)中的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胞嘧啶-重亞硫酸鹽衍生物,這個(gè)反應(yīng)是可逆的;接下來(lái)胞嘧啶-重亞硫酸鹽衍生物發(fā)生不可逆的水解脫氨基過(guò)程,形成尿嘧啶-重亞硫酸鹽衍生物。最后在高pH條件下尿嘧啶-重亞硫酸鹽衍生物脫磺酸基形成尿嘧啶。只有未甲基化的胞嘧啶在重亞硫酸鹽處理下發(fā)生堿基變化, 5-mC5-hmC仍然保持不變。轉(zhuǎn)化處理后的DNA經(jīng)PCR擴(kuò)增,尿嘧啶(U)轉(zhuǎn)變?yōu)樾叵汆奏ぃ?span>T)。重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化示意圖如下:

 

1 重亞硫酸鹽處理將未甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶

       Active motif公司的Bisulfite Conversion Kit提供優(yōu)化的轉(zhuǎn)化試劑、簡(jiǎn)單易用的操作步驟以及陽(yáng)性對(duì)照PCR引物,簡(jiǎn)化了DNA甲基化檢測(cè)的過(guò)程。整個(gè)轉(zhuǎn)化可在1.5小時(shí)之內(nèi)完成,轉(zhuǎn)化效率高達(dá)99%。試劑盒提供轉(zhuǎn)化特異性PCR引物,可用于測(cè)序前驗(yàn)證重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化效率。陽(yáng)性對(duì)照PCR引物適用于重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化處理的人和小鼠DNA,經(jīng)PCR擴(kuò)增可得到220 bp的產(chǎn)物。

Active motif同時(shí)也提供MethylDetector?重亞硫酸鹽修飾試劑盒,該試劑盒是Active motif公司最初提供的一款DNA甲基化檢測(cè)試劑盒,原理和Bisulfite Conversion Kit一樣,但轉(zhuǎn)化時(shí)間需要5小時(shí)。

2 Bisulfite Conversion Kit 操作流程

使用Bisulfite Conversion Kit,將目的DNA用蛋白酶K處理,加入重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑和DNA變性劑,在溫度循環(huán)儀中進(jìn)行快速熱變性。經(jīng)過(guò)1.5小時(shí)的DNA轉(zhuǎn)化反應(yīng),樣品加入到試劑盒里的DNA純化柱,脫鹽后洗脫DNA,可用于PCR或其他的下游實(shí)驗(yàn)。

3 陽(yáng)性對(duì)照轉(zhuǎn)化特異性PCR引物可用于特異性擴(kuò)增轉(zhuǎn)化后的人和小鼠DNA

使用Bisulfite Conversion Kit處理人(A)和小鼠(B)基因組DNA,處理(Bis)和未處理(Untr)的DNA分別用陽(yáng)性對(duì)照轉(zhuǎn)化特異性PCR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增分析。陽(yáng)性對(duì)照PCR引物專(zhuān)門(mén)適用于經(jīng)重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化的DNA,因此會(huì)擴(kuò)增出220bp的條帶,而未處理的DNA沒(méi)有擴(kuò)增出相應(yīng)條帶。

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 Bisulfite Conversion Kit

 50 rxns

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 MethylDetector?

 50 rxns

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 Fully Methylated Jurkat DNA

 10 μg

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 55007

 Jurkat genomic DNA

 10 μg


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